在大换装的基础上，陈宪对军队的组成方式进行了大幅度的改革。
首先，他将步兵方阵中火枪兵的人数大幅度提升，达到和长枪兵一比一的比例。
一个步兵营的人数由原本的六百多人提高到了九百多人，其中四百长枪兵，四百火枪兵，他取消了步兵方阵中斧枪兵和剑盾兵。
在历次的战斗中，陈宪发现，这两种兵种的使用频率相对比较低，而且难以训练。
火枪兵人数提高之后，就不能在布置在长枪方阵四角了，而是放在了长枪兵方阵的两侧，组成两个和长枪方阵一样，十排纵深的方阵，这样的纵深，哪怕是用火绳枪，也能打出持续性的火力攻击。
为了在受到骑兵冲击时，更好的保护火枪兵，陈宪在火枪兵方阵的最外围防止了一圈长枪兵，当作战时，这些长枪兵将会蹲下来形成拒马，火枪则在他们的保护下向外开枪。
陈宪还给每个步兵营配备了大约一百人的掷弹兵，这些士兵体格强壮，能够将用铸铁制作的沉重手雷扔出去很远。
这些掷弹兵除了配备沉重的手雷，还配备着精度较高的转轮火枪以及刺刀，陈宪还对这些士兵进行了严格的射击训练和肉搏训练，让他们可以发挥更多的作用。
在陈宪的设计中，掷弹兵是方阵中的自由人，他们也是方阵的侦察兵和警卫哨兵。
陈宪考虑再三后，在马步兵中也编制了一些长枪手，用来在作战中保护火枪手，不过这种长枪手人数比例比较低，只能在火枪手外围形成一圈的拒马。
为了增强轻骑兵的作战能力，陈宪别出心裁的制造出了转轮打火的火枪。
转轮打火，解决了火绳枪在马背上使用的不便，让轻骑兵能在马背上也能方便射击。
陈宪之所以要开发复杂又不可靠的转轮打火装置，一是为了推迟燧发枪暴露的时间，二也是为了积累一些技术，为将来发展钟表制造业打下一些基础。
之所以要发展钟表业，一方面精确的计时和守时的观念，对于工业社会来说，十分重要，另外，钟表在航海上也非常重要，虽然不知道在自己的有生之年能不能发展处航海钟这种航海里程碑式的东西，但至少也得朝这方面去努力。
转轮打火设备并不复杂，和老式的打火机很像，一个表面有着类似老式硬币外援齿痕的转轮，转轮下面安装一个燧石，燧石下面有一个弹簧将燧石推着抵住转轮，拨动转轮，就能摩擦出火花，进而点燃火药。
火枪的转轮打火装置中，转轮的转动力量由发条提供，士兵先上紧发条，然后扣动扳机，松开发条的锁紧装置，发条的势能释放，推动转轮转动，摩擦燧石，擦出火花……
发条的制造，陈宪采取了先用精炼的铁片卷成型，在将铁卷进行渗碳淬火……
推动燧石的弹簧用簧片代替，燧石打磨成柱状，安装在燧石桶里，依靠簧片和顶杆施加压力，抵住转轮。
这样的装置，对于陈宪目前的手工作坊来说，并不困难。
不过因为产量问题，这种转轮火枪只供给轻骑兵和掷弹兵。
有了这种火枪，轻骑兵就能在马上开枪和装弹。
有了能在马上使用的火枪，陈宪尝试着让轻骑兵训练组成横排，冲到火枪射程内，对着敌镇打出一个排枪，然后调转马头离开，重新装弹，这种战术已经接近后世十八世纪的猎骑兵了。
为了增加轻骑兵在追击时的持续作战能力，陈宪还给每个轻骑兵装备了两把短火枪，作为备用枪械，以及一把轻便的马刀作为最后的武器。
这样的轻骑兵有着训练比较简单，对战马要求不高，火力凶猛，行动迅速，机动性高，用途多样的有点，补充起来也比较容易，不像弓骑兵，要花费大力气才能训练出来，还肯定不是蒙古骑兵的对手。
陈宪花费了半年时间才完成了这次军事改革。
他一边对军队进行改革，一边招募新兵补充进增员后的军队，一边扩大军队的规模。
在完全掌控了莱芜县的八万多人口之后，陈宪自然就有了大规模扩军的资本。
经过半年时间的招募和训练，陈宪将军队扩大到了八个步兵营，七千多人，骑兵扩大到了两千四百人。
陈宪对骑兵的编制是一百人一个连，四个连一个营。
这次他将每个骑兵兵种都扩编到了两个营。
这样一来，陈宪手下就有了八个步兵营，六个骑兵营，总兵力接近一万人！
陈宪又将八个步兵营分别组成了两个步兵团，一团团长由李石担任，二团团长由张柏担任。
除了军队的扩张和改进，在政府方面，陈宪也进行了调整，他将手中的地盘分为莱芜和沂源两个县。
莱芜县令由陈宪自己兼任，他在莱芜县也成立了一套和沂源县一样的县级政府机构。
在县级政府机构之上，陈宪自封为鲁山侯，组建侯国政府，在这一级政府，陈宪没有成立督政院，而是由侯爵，也就是自己独裁，侯国法院，侯国检察院，都是侯府的下属机构，审计院也由督政院的下属机构变成了侯府的下属机构。
之所以采取这种地方选举自治，中央独裁的的行政模式，是因为陈宪觉得，如果他太早的在上层实现选举制度，会让他建立的这个势力会失去控制，而没有陈宪亲自把控方向，那谁也不知道这个势力最终会发展成什么样子。
陈宪还在侯府下面成立了将军府，也由自己担任将军府将军。
在将军府下面，他成立了负责制定作战计划的参谋部，负责后勤补给的后勤部，负责武器装备研发采购的装备部，负责军纪军法的宪兵部，负责训练的武训司，负责军官的考察，评定，升迁，调职的武选司，负责军事情报的情报司……
当然，这些机构虽然建立起来了，但大多还是个空架子，还需要时间去明晰各个机构的职权范围，逐渐丰满工作流程，这些东西，陈宪不可能都去亲力亲为，他没有那个精力和能力。