石英大会的决赛已经进入最终决战，小银的最后一只神奇宝贝竟然是冰系神兽急冻鸟，这让在场的所有人的都大吃一惊，还好小智早有准备，派出喷火龙进行反击，但实力上的差距让喷火龙接连受挫，眼看就要被击倒，小智终于拿出了最终的秘密武器，Mega进化。
赛场内的喷火龙周身被炽热的火焰包裹，透过火焰可以隐约看到喷火龙的体态发生了极大的变化，随着火焰逐渐消散，一只全新的喷火龙出现在观众面前。喷火龙脑后长出了中间的第三根角，这根角比原来两根都要长。脖子和嘴巴都变得更短，同时其四肢，尾巴和翅膀都变得更长。仔细观察后还会发现，喷火龙前爪的手腕处长出了小型的翅膀；背后翅膀的边缘变得更加不规则；尾巴末端长出了三个小型突刺而背上长出了一根长突刺。尾巴上的火焰燃烧的更加旺盛。
“出现了！小智选手的喷火龙再度发生了令人惊讶的变化，虽然不太清楚小智选手口中所说的Mega进化到底是怎么回事。但是很明显，小智选手的喷火龙已经发生了翻天覆地的变化。”主持人惊讶于小智喷火龙的变化，同时Mega进化这一新鲜事物的出现也让在场的观众充满了疑惑。
“看样子是装备上了Y进化石，这样也好，Mega喷火龙X的龙属性在这里并不占优。”小智看到场地内的超级喷火龙Y异常兴奋，没想到自己有一天也能拥有超进化的能力。
超级喷火龙Y简单熟悉了一下自己新的身体，随后仰天怒吼，巨大的威能以喷火龙为中心向着四周扩散，感受着Mega进化给它带来的强大力量。
小银也从喷火龙的异常变化中反应过来，“切，什么狗屁Mega进化，在绝对实力面前，任何变化都是徒劳。”小银继续放着狠话，并没有把喷火龙的变化放在心上，这正是小智想要的结果。
另一边，赛场内隐藏在暗处的火箭队员第一时间将场内的信息传达给了坂木。同样第一次看到Mega进化的坂木也十分不解，立刻吩咐手下开始打探消息，突然出现的变故也让坂木心中产生了一丝顾虑。
“喷火龙！让我们继续吧！让他见识一下我们新的力量！喷射火焰！”回到赛场，小智开始了反击。超进化后的喷火龙各项能力都有了大幅度的提升，巨大的双翼换来了更加敏捷的飞行速度，喷火龙迅速来到高空，一发威力超乎寻常的喷射火焰直冲急冻鸟而去。巨大的火焰光柱让在场的观众都感受到了高温炙烤。
“急冻鸟！高速移动躲避！”小银也感受到这招威力非同寻常，不敢正面硬抗，急冻鸟依旧像个木偶一样，在黑暗球的作用下机械的坐着反应。
急冻鸟在空中不断闪避，但是超级喷火龙并不打算放过他，喷射火焰持续输出，不断追击着急冻鸟的移动位置，连续的躲避让急冻鸟的移动速度出现了下降，喷火龙抓住机会，加大了技能的释放力度，一发喷射火焰准确命中了急冻鸟的后备，急冻鸟重重的摔倒了地上。
“太让人惊讶了！经历了重大变化的喷火龙实力大幅提升！战局瞬间被扭转，小银选手和急冻鸟陷入大危机！”主持人激动的喊叫着，十分惊讶于喷火龙的变化。
面对如此实力如此强劲的喷火龙，小银不得不重视起来。他收起了之前轻蔑的态度，开始严肃的对待这次比赛。“急冻鸟！再次使用白雾！”小银开始布置战术，白雾从急冻鸟的口中喷出，白茫茫的一片瞬间笼罩了整个战斗场地。
“喷火龙！提高警觉！随时准备躲避！”接到小智的指令，喷火龙随即摆出防御姿态，巨大的双翼随时准备着护住要害，锐利的眼神注视着赛场内的一举一动，随时准备抓住机会反击。
突然，急冻鸟从白雾中杀出，双翼闪耀着白色的光芒，钢翼绝招袭来。速度之快让喷火龙来不及躲闪。就在这时，小智发出了一道让所有人惊讶的指令，“喷火龙！接下这一招！”小智的指令让观众倒吸一口冷气，但之间喷火龙嘴角微微上扬，看样子小智的指令很对它的胃口，喷火龙双臂发力，在被攻击到的瞬间，死死的抓住了急冻鸟的双翼，巨大的冲击力让喷火龙连连后退，但它依旧死死抓住对手。
“喷火龙！维持住这个状态！地球上投！”小智祭出喷火龙招牌的地球上投，喷火龙抓住急冻鸟开始急速旋转，巨大的离心力让急冻鸟陷入混乱，喷火龙抓住时机急速下坠，将急冻鸟狠狠的叩打在地面上。
以急冻鸟为中心，强烈的冲击波将战斗场地冲击的四分五裂，赛场内烟尘四起，喷火龙在攻击后迅速回撤，它很清楚这一击并不会给急冻鸟造成致命的损伤，此时它正严阵以待，等待着来自急冻鸟的反击。
“很好，你们成功引起了我的注意，急冻鸟！连续的水波动！”小银的声音从烟尘中缓缓传来，平静的声音却给人一种冰冷的感觉，小银话音未落，急冻鸟冲出烟幕，身体上喷火龙带来的伤害还清晰可见，但急冻鸟就像没有痛觉一样，麻木的没有一丝生机。急冻鸟连续释放出蓝色的水球，喷火龙快速提升高度，在空中不断闪转腾挪，躲避着急冻鸟的进攻。
“急冻鸟！急冻光线攻击水波动！”小银开始改变战术，急冻光线一一命中之前的水波动，蓝色的水球凝结成一颗冰球，而急冻光线成了助推器，一颗颗冰球加速攻向喷火龙。喷火龙的躲闪越来越吃力，最终还是被一颗冰球集中，被击中的瞬间冰球炸裂开来，尖锐的冰晶碎片给喷火龙带来了不小的伤害，更糟糕的是冰球接连袭来，此时的喷火龙已经无力躲闪，被击落到地面。
“很好！急冻鸟！展现你的威力吧！心眼！”小银愈发的癫狂，急冻鸟释放出心眼技能，喷火龙瞬间感觉到自己被锁定了，而且怎么都摆脱不了这种状态。
“糟了，又来这一招，下一回合就是胜负手了，喷火龙！积蓄力量吧！冲上去使用炼狱！”小智自知被心眼锁定后将无法躲避，只得放手一搏，喷火龙再次起飞，口中凝聚着炽热的火焰，直冲急冻鸟而去。炼狱本就是命中率极低的绝招，这种状况下，小智只能拉近攻击距离，以求提高命中率。
“没用的！你的一切行动都只是徒劳了！见识一下神的力量吧！急冻鸟！绝对零度！”小银喊出了那个恐怖的招式名称。
“出现了！一但被命中之后就会直接失去战斗能力，冰系神奇宝贝的最终奥义，绝对零度！而且还是被心眼锁定后的绝对零度！百分百的命中率！小智选手和他的喷火龙恐怕凶多吉少了！”主持人奋力的呼喊，在场的观众也已经开始为小智惋惜。
喷火龙奋力进攻，炼狱绝招超近距离命中，熊熊燃烧的深红色火焰瞬间包裹住了急冻鸟，这一刻观众似乎也看到了小智逆转的机会。
可是随后，一道几乎看不到形态的银白色光线划破火焰，温度瞬间降至冰点，空气中的水蒸气也变成了冰晶不断的掉落在地面，赛场上的一切仿佛被定格了，勇往直前的喷火龙还维持着冲锋的姿态，口中的火焰还在剧烈的燃烧，但此时的他已经变成了一座冰雕，被冰封在了战斗场地中央。
“还是没能打断这一招啊...”小智也意识到这一场，自己的战术并没能奏效，被冰封的喷火龙体型逐渐恢复成常态，这也预示着它已经失去了战斗能力。裁判员进入赛场，观察一会后宣布了比赛结果，急冻鸟成功扳回一城。
“回来吧！喷火龙！你做的已经很好了，我们的实力还是有待磨炼啊，下一次在遇到急冻鸟，我们一定不会再输了。”小智默默握紧了手中的神奇宝贝球，暗暗下定了决心。
“哈哈！你的王牌已经被我解决掉啦，看你还有什么底牌可以战胜我的神鸟！”此刻的小银感觉自己胜券在握，疯狂的嘲讽着小智。
小智看着自己的伙伴，耿鬼的话太脆了，及时之前的食梦回复了不少的体能，但是急冻鸟的一招估计就可以秒掉耿鬼；快龙的话弱点太过明显，4倍弱冰让快龙打起来会缩手缩脚。随后，小智看向了自己的最后一只神奇宝贝，那颗高级球里躺着的正是闪电鸟，此时的高级球在不断的晃动，似乎也感受到了赛场内急冻鸟的气息，忍不住想要出战了。
“这么跃跃欲试么？那就给你这个机会吧！就决定是你了！上吧！闪电鸟！”小智最终还是决定派出自己的终极杀招，神与神的对决就要在石英大会的决赛上演了。
石英运动场的上空乌云骤聚，密密麻麻的雷电在云层中穿梭，伴随着小智的呐喊，一道闪电划过天空，一只金黄色，浑身布满雷电能量的神奇宝贝出现在天空中，空气中充斥着噼里啪啦的电流声。
“这...这...这...我不是在做梦吧！传说中关都地区掌控雷电的神！传说中的神鸟竟然会同时出现在石英大会的决赛场地上！小智选手的最后一只神奇宝贝竟然也是三神鸟之一的闪电鸟！”
闪电鸟的出现惊呆了赛场内的所有人，小刚和小霞还好，早就知道小智的底细，小茂此时已经坐不住了，自己的青梅竹马竟然已经可以驾驭神兽，这让他多少有些不自在，此时也是暗暗下定决心，迟早要追上小智的脚步。
对面的小银同样惊讶于闪电鸟的登场，原以为自己的急冻鸟一出场就可以横扫一切，但是由于之前喷火龙的奋力反抗，此时的急冻鸟已经受伤惨重，对上普通的神奇宝贝还可以轻松应对，但是对上同为神鸟的闪电鸟，此时的状态已经是强弩之末了。
赛场外，坂木第一时间收到了场地内的实时消息，此刻的他才意识到，小智给自己的计划带来了多大的变数。“可恶的小鬼！原来闪电鸟的计划也是被他破坏的。看样子我对他还是太过仁慈了。来人！”坂木阴沉的声音叫来了门外的火箭队员。
“老大！有什么吩咐！”门外的人恭恭敬敬的问到。
“吩咐下去，计划提前，所有人做好准备，比赛结束的那一刻就是我们动手的时间！”坂木吩咐着手下，闪电鸟的出现让坂木不得不调整自己的作战计划。一切交代完毕，坂木也起身出发，前往石英高原。
回到石英运动场，最终的决战即将打响。裁判也已经被神鸟的威能惊呆了，颤颤巍巍的声音宣布着比赛开始的口号。
“闪电鸟！十万伏特！”小智率先发难，闪电鸟挥舞着双翼，强大的电流在羽翼间流动着，随即闪电鸟奋力挥动着翅膀，数道强大的电流直充急冻鸟而去。
“急冻鸟！高速移动！”小银也知道此时的急冻鸟不能再多受一次攻击了，急冻鸟立刻反应，不断移动着躲避闪电鸟的攻击。小智不打算给急冻鸟喘息的机会，立刻指挥闪电鸟追了上去。
“闪电鸟！神鸟特攻！”闪电鸟接到指令，瞬间收拢双翼，身体犹如利剑划破长空，瞬间击中急冻鸟，巨大的冲击力让急冻鸟重重的摔倒了地上，虽然属性不佳，但是绝招威力十足，急冻鸟受到了不小的伤害。
“乘胜追击！打雷！”小智丝毫不给对手反应的时间，闪电鸟刚刚摆脱神鸟特攻的反作用力，随即向着天空发出鸣叫，随后一道闪电从云层中落下，无数道雷电犹如雨点般落在了急冻鸟的身上，赛场内只传来急冻鸟的哀鸣。落雷的能量将赛场的巨石全部击碎，整个战斗场地已经变得惨不忍睹。
“可恶！快反击啊！快飞起来！”小银丝毫不在乎急冻鸟收到的伤害，催促着急冻鸟抓紧反击。被黑暗球控制的急冻鸟挣扎着从地上爬了起来，摇摇晃晃的再次起飞，连续受到大绝招的攻击，此刻的急冻鸟已经有如风中残烛，随时可能凋零。
看到急冻鸟挣扎的姿态，小智虽有些于心不忍，但也知道只有打败小银，才能让急冻鸟获得解脱。“闪电鸟！给他最后一击！十万伏特！”小智狠下心来发动最后的攻击，闪电鸟毫不留情的释放着闪电能量，一道巨大的雷电击中了急冻鸟，没有丝毫的反抗，急冻鸟再一次重重的砸在地上，这一次再也没能站起来。
“急冻鸟失去战斗能力！闪电鸟获胜！胜利着是真新镇的小智选手！”裁判员第一时间冲进场内确认比赛结果。
“结束了！小智选手的闪电鸟以压倒性的优势战胜了同为神鸟的急冻鸟！本次石英大会的冠军就此诞生！那就是来自真新镇的小智选手！！！”主持人再次宣读了比赛的结果，观众们山呼海啸般的欢呼声随之而来，小智的朋友们也向他报以掌声，祝贺他获得了冠军。
小智此时也感受到了获胜后的喜悦心情，自己来到这个世界一年来的努力终于有了收获。而此刻的小银正经受着和小智截然不同心情，失落、愤怒、不甘充斥着他的内心，眼泪也从眼角滑落，他没想到及时派出了神鸟，依旧没能获得最终的胜利。
就在全场观众期待着最终颁奖典礼的时候，异变突生，一个巨大的飞行器出现在石英运动场的上空，在场的观众面面相觑，不知道到底发生了什么，但小智此时反应过来，火箭队的行动开始了。
这时，一个熟悉的声音从飞行器的扩音设备中传来，“回来吧！小银，收起你的不甘，失去的东西再夺回来就好了。”小银擦干了眼角的泪水，抬头望向天空，不甘的向场外走去。飞行器上，坂木透过摄像头观看着赛场内的一举一动。
“各位观众，请不要害怕！我是邪恶组织火箭队的领袖坂木，我们火箭队这次的目标只是圣火，当然各位的神奇宝贝还请配合交给我们保管，不要妄图反抗，以免造成不必要的伤亡。”坂木儒雅的声音缓缓的陈述着此行的目的。接着，无数身穿火箭队制服的队员从飞行器上速降下来，开始抢夺神奇宝贝。
“什么邪恶组织啊？是坏人么？”“火箭队是什么？”“我们的神奇宝贝为什幺交给你们？”观众们你一眼我一语的讨论着，大多数人都不太了解火箭队的背景。
此时，小智注视着选手通道，阿渡他们这个时间还没到场，肯定是被人引到了别处，现在也只有靠自己了。
“大家！不要听他的话！火箭队是四处抢夺神奇宝贝的邪恶组织，大家要相信神奇宝贝的力量，用我们自己的方式进行反击！”小智在赛场内呼吁着观众们起来反击，也许是小智之前的表现让观众们比较信服，观众们纷纷拿出自己的神奇宝贝开始反击。
小刚、小霞和小茂也第一时间来到小智身边，和他并肩战斗。他们即将面对的正是坂木手下的四将军。